Sasuke aperçoit Itachi dans la forêt et pars immédiatement à sa poursuite. Alors qu’Itachi n’attend pas son frère, celui-ci l’attaque avec son Susanoo mais son frère se défend avec le sien. Itachi qui ne semble pas vouloir s’arrêter répond qu’il a quelque chose d’important à faire tout en se dirigeant vers la planque de Kabuto. Sasuke, qui a tout un tas de question à lui poser, n’est pas prêt à renoncer et suit son frère jusqu’à destination.
Tout en avançant, Sasuke dit qu’il sait tout de lui. Il explique également qu’il lui a pris ses yeux et demande pourquoi Itachi l’a épargné. Itachi lui répond que c’était pour qu’un Uchiwa puisse le tuer pour ce qu’il à fait. Il réalise finalement qu’il a échoué car Sasuke a déserté Konoha et est devenu un criminel. Itachi décide de couper court à la conversation, jugeant qu’il n’a plus rien à dire à son frère pour l’instant et qu’il doit se concentrer sur sa mission.

De retour sur le champ de bataille avec Madara, celui-ci décide de tuer Tsunade en premier puisqu’elle est une descendente d’Hashirama. Il la dénigre complètement, mais cette dernière à hérité de la volonté du Feu et compte bien montrer de quoi elle est capable même sans Mokuton et régénération sans signes incantatoires.

Tsunade prétend pouvoir battre Madara avec la volonté du Feu. C’est grâce à cette volonté qu’elle à créé les 3 règles du Ninja médical : toujours soigner ses amis tant qu’on est en vie, ne jamais combattre, être le dernier à mourir. Néanmoins, elle a une dernière règle : ceux qui maîtrisent le « Byakugou », la régénération instantanée, peuvent s’affranchir des 3 premières règles !
Tsunade active son sceau qui s’étend du front jusque sa poitrine, et s’élance sur Madara pour frapper son Susanoo. Il constate qu’elle est moins rapide que le Raikage, mais qu’elle est plus forte que lui. La Mizukage protège ses alliées du feu de Madara, pendant que le Raikage et le Tsuchikage essaie de le frapper. Susanoo se brise enfin. Madara constate que Tsunade n’est pas si faible qu’il le dit.

Sur un autre champ de bataille, Choze explique à Dan que Madara est revenu à la vie, mais que les Kage l’affrontent en ce moment même, y compris Tsunade, ce qui ne manque pas de le surprendre.

Du côté de Madara, Tsunade le frappe si fort qu’elle lui transperce le torse. Aussitôt le Kazekage tente de le sceller. Cependant une branche transperce Tsunade en plein ventre, c’était un clone Mokuton. Selon Dan, personne ne peut battre Madara à part le 1er Hokage et il espère que Tsunade ne va pas mourir.

Plus loin, Itachi et Sasuke arrivent devant Kabuto. A peine arriver, celui-ci leurs explique qu’ils ne pourront pas arrêter l’Edo Tensei s’il le tue.

Itachi et Sasuke sont face à Kabuto afin d’annuler l’Edo Tensei.
Pendant ce temps-là, les cinq Kage sont toujours face à Madara. Tsunade brise la branche qui l’avait transpercé et frappe violemment Madara au corps, afin de créer une ouverture pour laisser le Tsuchikage lancer son attaque Jinton. Mais sans succès, car Madara l’absorbe avec son Rinnegan. Puisque Madara se bat à 5 contre 1 il décide d’inverser les rôles et crée alors 25 clones Mokuton, 5 par Kage. Cependant il leurs laisse le choix de décider si les clones utiliseront Susanoo ou pas.

Dans le repaire de Kabuto, celui-ci essaie de convaincre Sasuke que Itachi est une nuisance pour eux deux. Après bref réflexion, les deux frères s’allient pour le vaincre.

Sasuke et Itachi sont toujours en face de Kabuto. Afin de se protéger d'un éventuel Genjutsu des deux frères, celui-ci prend le soin de cacher son visage. Sasuke et Itachi en savent beaucoup de ses serpents mais il leurs explique que ce n'est pas en connaissant leurs mystères qu'ils arriveront à le vaincre.

Il débute le combat en utilisant ses serpents mais les deux frères se protègent avec leurs Susanoo respectifs. Ils n'arrivent pas à toucher Kabuto car celui-ci se cache. Il dévoile aux deux frères qu'il utilise la capacité de liquéfaction de Suigetsu, il explique aussi qu'il a gagné énormément de pouvoir après avoir étudier le corps d'une Uzumaki, l'ancienne compagne de Sasuke, Karin.

De plus, il montre la même capacité avec la nature que Juugo à la différence qu'il l'a perfectionné grâce à un entrainement au Ryuchidou, l'antre des Dragons. Dirigé par le grand sage serpent, l'entrainement de Kabuto lui a permis de surpasser Orochimaru et ainsi de devenir un Sennin. Son pouvoir en mode Sennin est celui des dragons.

Après avoir activé le mode Sennin Kabuto lance un jutsu. Le dragon issu de son jutsu devient une boule et éblouit Sasuke et Itachi. La lumière et le son nuisent aux capacités oculaires et auditives des deux frères. Leurs corps sont aussi engourdis à cause des vibrations dans l'air.
Grâce à la cornée des serpents, Kabuto peut se protéger de la lumière. Il utilise son pouvoir de liquéfaction pour se protéger du son et des vibrations. Il est donc le seul a pouvoir se déplacer librement quand il est en mode Sennin. Il profite de la paralysie des deux frères pour s'attaquer à Sasuke mais Itachi parvient quand même à le protéger. Sasuke utilise sa lame de foudre mais ne parvient pas à toucher son ennemi. Kabuto leur explique qu'ils ne sont pas assez préparés pour faire équipe ensemble.

Afin de le contre dire, Itachi remémore à son frère une scène dans la Transaction d'Inoshishi, ainsi débute l'enchainement des deux frères qui finalement porte ses fruits car Itachi réussit, après avoir trompé Kabuto avec un de ces clones, à fendre une de ses cornes. Vaincre leur ennemi n'est peut être finalement pas impossible pour les deux frères.

Un monologue débute, Kabuto cherche à connaitre les véritables intentions de Sasuke vis-à-vis de la discussion qu'il veut avoir avec son frère, Itachi. Il veut connaitre la vérité de la bouche de son frère. Kabuto comprend alors pourquoi Sasuke n'est pas retourné à Konoha après avoir vaincu son frère, il cherche à détruire le village pour la souffrance qu'ils ont causés à Itachi. Kabuto propose alors à Sasuke de trahir son frère et de venir de son côté, car leurs buts sont les mêmes. Il veut poursuivre ce que Orochimaru avait commencer : la chute de Konoha.
Sasuke se souvient alors d'une discussion dans un bar, des ninjas de Konoha qui insultaient Itachi de traitre. Sasuke qui voulait venger la mémoire de son frère était interrompu par Tobi qui lui disait que personne ne connaissait la vérité et que personne ne l'a croirait.

Kabuto se lance ensuite dans des explications où il tente de justifier son comportement. Lui aussi, depuis sa naissance, il n’a pas de réelle identité et vit dans un monde de mensonges. Itachi demande à son frère de ne pas écouter Kabuto et que malgré les mauvais côté et incohérence du village il restera toujours Uchiwa Itachi de Konoha. Il le prévient qu'il lui reste encore quelque chose à confesser mais seulement quand ils auront vaincu l'ennemi.
Itachi dévoile alors son atout qui est autre que la technique qui forme une paire avec l'Izanagi de Danzô, le Dôjutsu ultime qui contrôle le destin, Izanami.

Suite à la découverte du jutsu de Itachi qui porte le nom d'Izanami, Kabuto ne compte pas se laisser faire et utilise un jutsu qui donne vie à toute la grotte. Il essaye de paralyser Itachi pour pouvoir réécrire son esprit et ainsi reprendre son contrôle. Cependant Itachi se protège en créant un cercle grâce aux flammes d'Amaterasu et ainsi tenir à l'écart Kabuto.
Celui-ci qui, grâce aux connaissances qu'il a acquise sur le monde naturel, prétend être le plus proche du Rikudô Sennin. Itachi voit son reflet dans Kabuto car ils étaient tout deux des espions, mais contrairement à lui, Itachi a atteint la perfection en acceptant qui il est.

Cependant Kabuto dit qu'il est à la recherche de lui même depuis le début et il commence à raconter son histoire. Il a été retrouvé blessé par une jeune femme qui l'a soigné et baptisé "Kabuto". Afin qu'il puisse voir, elle lui donna ses lunettes. Cette femme, Nonô, sera à ses yeux, sa mère adoptive.

Kabuto continue son histoire. Au fil du temps il devient un très bon ninja médecin.
Dans un camp de soin, il fait la rencontre d'Orochimaru qui lui propose de devenir un shinobi mais celui-ci ne semble pas intéressé. Orochimaru était à ce moment-là un membre de la Racine sous les ordres de Danzô qui était venu essayer de recruter à nouveau Nonô afin de l'envoyer dans une mission de reconnaissance à long termes dans le village d'Iwa. Celle-ci, contre son gré, accepte sa requête.

Afin de remplacer un de ces hommes mort, Danzô veut aussi un des "enfants" de Nonô. Kabuto, qui écoutait discrètement la conversation, décide de les rejoindre de son plein gré afin de devenir un ninja et de perfectionner ses capacités médicales.

Le temps passe, les identités de Kabuto changent et un jour, il se retrouve à Iwa et tombe sur sa mère adoptive qu'il blesse... Il essaye de la soigner mais celle-ci ne le reconnait pas. Il s'échappe et se regarde dans l'eau mais peu à peu, lui non plus, ne se reconnait plus. Orochimaru apparait devant lui.

Suite de l'histoire de Kabuto. Orochimaru lui explique pourquoi Nonô ne l'a pas reconnu : tout les deux étaient trop doués en tant qu'espion aux yeux de Danzô. Ainsi pour s'en débarrasser, il a décidé qu'ils devaient s'entre-tuer.

Afin que Nonô ne puisse pas reconnaitre Kabuto, Danzô lui a fait un lavage de cerveau en lui montrant régulièrement des photos de son fils adoptif. Elle voyait grandir Kabuto jusqu'à ce que Danzô finisse par lui donner des photos d'une autre personne. Un procédé lent et efficace.

Fou de rage, Kabuto se lance sur Orochimaru et le roue de coups. Orochimaru ne bouge pas et lui montre sa capacité de "renaissance", il lui explique qu'il pourra avoir toutes les réponses qu'il souhaite s'il travaille pour lui.
Kabuto, aveuglé par la soif de connaissance, le suit. Après avoir étudié tout les sujets possibles et imaginables, il finit par s'injecter les cellules d'Orochimaru.

Kabuto a terminé son histoire et est toujours à la recherche de sa personnalité. Il continue d'attaquer et fait une démonstration de toutes les cellules qu'il a absorbé : Jiroubou, Kidoumaru, Kimimaro, Orochimaru, Tayuya, ils font tous partis de lui ainsi que leurs pouvoirs respectifs.

Itachi et Sasuke luttent tant bien que mal pour survivre. Ils s'entraident grâce à leurs Sharingan pour se libérer du Genjutsu de Tayuya. En se libérant ils parviennent à stopper l'élan du serpent blanc de Kabuto. Celui-ci surgit cependant de la bouche de l'un d'eux et parvient à découper Itachi en deux.

Itachi a été coupé en deux par Kabuto qui s'apprête à lui donner le coup de grâce mais Sasuke fais tout pour l'éloigner de son frère. Kabuto qui est plein de ressources parvient quand même à toucher Itachi mais ce n'était qu'un clone. Celui-ci est finalement sain et sauf aux côtés de son frère... pour le moment.

Kabuto continue de s'acharner sur lui mais ce n'est à chaque fois qu'un clone. Il continue ses attaques mais se fait à chaque fois piéger jusqu'à ce qu'il se fasse couper sa corne, la même qui a été coupée quelques temps plus tôt.
Il ne comprend pas, il a scellé ses yeux afin de ne pas tomber dans un piège de Genjutsu. Kabuto continue ses assauts mais c'est à nouveau un échec et sa corne est à nouveau coupée. Il a un sentiment de déjà vu.

La pupille gauche d'Itachi a changé de forme, Kabuto s'est retrouvé piégé dans une boucle temporelle pendant que dans la dimension réelle, le combat a déjà cessé. Cette boucle est appelée Izanami.

Izanami est activée. Cette technique agît sur les sens de l'adversaire et sacrifie la pupille comme pour Izanagi. Itachi explique à son frère que sa technique sert à enfermer l'ennemi dans une boucle illusoire infinie.
Pour l'activer Itachi doit mémoriser ses sensations corporelles lors du combat et les reproduire afin de piéger son ennemi dans la boucle. Cette boucle emprisonne son adversaire et se répète à l'infini.

Izanami a été créée afin de contrer Izanagi. Elle fût utilisée jadis pendant une ancienne guerre lors d'un combat que les Uchiwa ne pouvaient pas perdre. Cette technique permettaient de piéger d'autres Uchiwa insensible au Genjutsu "classique". Elle était utilisée pour les punir de vouloir trop modifier la réalité jusqu'à en perdre la tête. Toutefois il existe un moyen de sortir de l'emprise du Jutsu : reconnaitre ses erreurs et accepter la réalité telle qu'elle est et ne pas vouloir la changer. Itachi souhaite sauver Kabuto car ils se ressemblent.

De son côté, Kabuto est toujours piéger dans Izanami car celui-ci s'entête à vouloir devenir comme Orochimaru, il ne s'accepte pas tel qu'il est réellement. Il pourra sortir de la boucle une fois qu'il l'aura compris.

De retour sur le champ de bataille un shinobi attend la fin de cette guerre pour pouvoir rentrer chez lui et retrouver un jour son frère médecin de l'orphelinat. Itachi se prépare à mettre un terme à l'Edo Tensei.