Naruto qui a douze ans est recherché par l'Akatsuki. L'organisation est désormais redouté de tous, elle compte désormais une cinquantaine de membre très talentueux et ce nombre continue d'augmenter. Les Kage sont d'accord pour dire que l'état est critique. Ils ont donc décidé de créer un groupe des meilleurs genin de tous les pays. Cinquante groupes sont présentés mais seulement sept seront retenu pour recevoir un entraînement spécial dans le but de détruire l'Akatsuki. Tout repose sur eux.