L’époque des samouraïs et de la magie arrive au japon, Uzumaki Naruto vit une vie assez banal dans un petit village du nom de Tanzaku, à l'âge de ses six ans, le village est détruit par une personne du nom de Kuchiku Sefirosu. Naruto est le seul survivant, et décide à son réveil de venger son village et ses parents.